Η αξονική τομογραφία χρησιμοποιεί ακτινοβολία Χ για την απεικόνιση εγκάρσιων τομών του σώματος του ζώου. Το ζώο πρέπει να βρίσκεται υπό ηρέμηση / αναισθησία και να τοποθετείται σε ύπτια ή πρηνή θέση σε ένα κινούμενο κάθισμα το οποίο αργά διέρχεται μέσω μιας κυκλικής τρύπας του μηχανήματος.Σημαντική είναι η παρουσία κτηνιάτρου αναισθησιολόγου , ο οποίος μπορεί να ελέγχει τόσο την υγεία του ζώου όσο και τις λειτουργίες του ζώου που μπορούν να επηρεάσουν την ποιότητα της εξέτασης.Με αυτήν τη μέθοδο λαμβάνονται κάθετες λεπτές τομές του σώματος.Οι εικόνες αποθηκεύονται στον υπολογιστή και μπορούν να μεταφερθούν οπουδήποτε , συνήθως αποθηκεύονται και σε CD με πλεονέκτημα να μπορεί να γίνει διάγνωση σε οποιονδήποτε άλλον υπολογιστή με τη χρήση κατάλληλων προγραμμάτων.Τα συμπαγή μόρια απεικονίζονται καλύτερα. Έτσι απεικονίζεται το εσωτερικό του σώματος και επιτρέπεται στον εξεταστή να αναζητήσει βλάβες μέσα στα όργανα ή να εντοπίσει ανωμαλίες σε σημεία που ήταν αδιανόητο να εντοπιστούν με την ακτινογραφία ή την υπερηχοτομογραφία.
Η αξονική σε σχέση με τη μαγνητική τομογραφία είναι πιό γρήγορη μέθοδος με αποτέλεσμα να μπορούμε να εξετάσουμε πολλά συστήματα σε μικρό χρονικό διάστημα όπως αξονική τομογραφία εγκεφάλου, κρανίου, τραχήλου ,θώρακος,κοιλίας,αρθρώσεων , έλεγχο οστεολυτικών εστιών κ.α .
Υπάρχουν πέντε γενιές υπολογιστικών τομογράφων ανάλογα με τη διάταξη της λυχνίας και των ανιχνευτών , την κίνηση και τον αριθμό των ανιχνευτών.Εξέλιξη της αξονικής τομογραφίας είναι η ελικοειδής αξονική τομογραφία(spiral) η οποία, πέρα από άλλα πλεονεκτήματα , παρέχει τη δυνατότητα ανακατασκευής των εικόνων, ώστε να έχουμε και τομές σε άλλα επίπεδα (μετωπιαία, στεφανιαία και λοξά), πράγμα που μέχρι τώρα μόνο η μαγνητική τομογραφία μπορούσε να κάνει.Όσο πιό προχωρημένης γενιάς είναι ο αξονικός τομογράφος τόσο πιο γρήγορη και ακτινής είναι η εξέταση.
Υπάρχει επίσης η δυνατότητα διαμόρφωσης εντυπωσιακών εικόνων τριών διαστάσεων (3D), που βοηθούν πολύ στην ορθοπαιδική και στην αγγειολογία-καρδιολογία.Η εξέταση μπορεί να ολοκληρωθεί με την ενδοφλέβια έγχυση σκιερής ουσίας (ιωδιούχο σκιαγραφικό) σε εξετάσεις όπου αυτό είναι απαραίτητο.